​La materia prima para la producción de etanol es la caña de azúcar. Bioenergy cuenta con 20.082 hectáreas de caña sembradas de diferentes variedades, las cuales han sido importadas desde Brasil y se han adaptado perfectamente al clima y a la región de los llanos orientales.

El modelo de siembra implementado se ha llevado a cabo bajo un diseño de curvas a nivel con sistemas de terrazas, lo que permite que el suelo retenga mayor humedad, evite la erosión por escorrentía  y no se requiera de fuentes hídricas naturales para el riego de los cultivos, protegiendo el medio ambiente.

Para conservar la sanidad de los cultivos respecto a la plaga conocida como Diatrea o Barrenador de la caña, Bioenergy libera en campo dos avispas (Cotesia Flavipes y Trichogramma), producidas en el laboratorio de Control Biológico de la compañía.​